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潔凈室工程與電子、醫療衛生、食物和化妝品行業密不可分，供給滿足出產需要的受控環境，直接影響產品的質量。但因各行業對潔凈室工程的潔凈程度要求是不一致的，因而在進行潔凈室工程設計時應遵守相關的規范，確保其環境達到所需的規范。

精密機械和精密化工產品出產的潔凈室工程隨著科學技術的開展，許多工業產品的出產加工對出產環境的無塵車間工程中含塵濃度提出極高的要求，這需要其出產環境中具有一定的空氣潔凈等級和出產過程所需各類相關物質的供應質量。

半導體、集成電路出產的潔凈室工程半導體資料提純作為開展半導體器件的重要基礎。由于大規模和超大規模集成電路的工藝要求，為得到高純度的硅資料，原料和中間媒介的高純度和高精度恒溫恒濕工程出產環境的潔凈度成為影響產品質量的一個突出問題。集成電路芯片的成品率與芯片的缺點密度有關，而芯片的缺點密度與空氣中粒子個數有關。因而，集成電路的高速開展，不只對空氣中粒子的尺寸有極高的要求，而且也需進一步粒子數；一起，關于超大規模集成電路出產環境中無塵車間工程的化學污染也有相關的要求。

化妝品、食物出產的潔凈室現代化妝品中大多含有蛋白質、維生素、氨基酸、植物萃取液等，這些組分為霉菌的滋生、繁衍供給了有利條件。因而，微生物的污染是影響化妝品質量的重要因素。化妝品出產過程中運用的潔凈室工程的對象主要是塵粒，與食物出產用的潔凈室要求類似。

在食物的出產過程中，設施的嚴格管理是確保食物的安全衛生，放置由于大腸菌、沙門氏菌造成的食物中毒或飲料中混入霉菌等的重要手法。